在《忍者必须死3》游戏中，每个忍者都有其独特的能力和特点，选择哪个忍者取决于玩家的喜好和游戏策略。以下是游戏中比较受欢迎的几个忍者：

1. 疾风忍者：疾风忍者拥有快速的移动速度和攻击速度，能够轻松应对一些低阶的敌人。升级忍者也能够获得更多的移速加成，这让疾风忍者在跑图、闯关中都很有优势。

2. 暗夜忍者：暗夜忍者的技能是能够隐身，这使得他在一些特殊场景下能够偷袭敌人，出其不意地击败敌人。同时，暗夜忍者在高级别副本中也能够发挥重要作用，如跑图、断后等。

3. 火影忍者：火影忍者是游戏中唯一的近战输出忍者，拥有强大的爆发力和控制力。升级忍者还能够获得更多的攻击距离和伤害加成，使得火影忍者在面对高阶的敌人时也能够轻松应对。

4. 苍牙忍者：苍牙忍者是游戏中的一位强力近战输出忍者，他的技能是能够召唤雷狼，可以对敌人造成范围伤害。在面对一些特殊场景和敌人时，苍牙忍者能够发挥出非常重要的作用。

5. 水月忍者：水月忍者是一位远程输出忍者，拥有不错的技能范围和持续伤害能力。升级水月忍者还能够获得更多的技能伤害和闪避率加成，让她在闯关中更加灵活多变。

除了以上几个忍者外，还有许多其他优秀的忍者可供选择。例如夜叉、月隐、玄狐等。每个忍者的强度也会随着玩家等级的提升而逐渐增强。

至于在游戏中的各个阶层，每个忍者的表现也会有所不同。以下是游戏中各阶忍者的特点：

500-100级时，玩家刚入门，大多数忍者都差不多，这个阶段主要熟悉游戏操作和躲避技巧。

100-500级时，玩家开始培养自己的主力输出忍者，可以根据自己的喜好选择培养的忍者，如疾风忍者、火影、苍牙等。

500级以后，玩家可以开始培养多个主力忍者，并注重阵容搭配和技能搭配。这时每个忍者的培养也会更加精细化，需要考虑技能、属性、装备等多方面的因素。

在游戏中，玩家可以根据自己的喜好和游戏需求选择合适的忍者和培养方案。此外，还可以通过参与活动、任务和收集资源等方式提升自己的等级和获取更好的装备和道具，进一步提升自己的实力和游戏体验。